住田 卓也 (スミタ タクヤ)

SUMITA Takuya

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職名

講師

取得学位 【 表示 / 非表示

  • 博士(農学)  京都大学  2019年03月

学内職務経歴 【 表示 / 非表示

  • 滋賀県立大学  環境科学部  生物資源管理学科  講師   2020年04月 ~ 現在

 

論文 【 表示 / 非表示

  • Marker-free genome editing in the edible mushroom, Pleurotus ostreatus, using transient expression of genes required for CRISPR/Cas9 and for selection

    Koshi D., Ueshima H., Kawauchi M., Nakazawa T., Sakamoto M., Hirata M., Izumitsu K., Sumita T., Irie T., Honda Y.

    Journal of Wood Science  Journal of Wood Science  68 (1)    2022年12月

    10.1186/s10086-022-02033-6  共著  

    [概要]

    In a previous study, we reported a transient transformation system using repeated screening for hygromycin B (Hyg) resistance in the basidiomycete Ceriporiopsis subvermispora. In the present study, by combining this technique with CRISPR/Cas9, we demonstrated successful marker-free genome editing in Pleurotus ostreatus, which is one of the most economically important cultivated mushrooms as well as a model white-rot fungus. At first, transformant selection mediated by the transient expression of marker genes was demonstrated using a plasmid harboring the Hyg resistance gene (hph) in P. ostreatus. Then, genome editing of fcy1, which confers 5-fluorocytosine (5-FC) resistance to the host cell, was performed by the transient expression of Cas9, gRNA, and hph and strains with 5-FC resistance and Hyg sensitivity were isolated. Additionally, genome editing of fcy1 in these strains was confirmed by Sanger sequencing. To our knowledge, this is the first report of marker-free genome editing through the transient expression of Cas9, gRNA, and hph in agaricomycetes, which opens the door for repeated genome editing in these fungi.

  • An exocyst component, Sec5, is essential for ascospore formation in Bipolaris maydis.

    Tsuji K., Y. Kitade, T. Sumita, C Tanaka

     Mycoscience  62 (5)   289 ~ 296  2021年

    10.47371/mycosci.2021.05.002  共著  共同(副担当)

会議での講演 【 表示 / 非表示

  • 菌寄生菌Dicyma pulvinataAspergillus属に保存されたdeoxyphomenoneの生合成遺伝子クラスター

    令和3年度日本植物病理学会関西部会  2021年09月

  • 菌寄生菌と麹菌が分泌するセスキテルペンdeoxyphomenoneの機能解析

    第31回イソプレノイド研究会  2021年09月

  • 菌寄生菌Dicyma pulvinataと麹菌Aspergillus oryzaeが分泌する抗菌性物質deoxyphomenoneの胞子形成における役割

    令和3年度日本植物病理学会大会  2021年03月

  • 菌寄生菌Dicyma pulvinataと麹菌Aspergillus oryzaeが分泌するセスキテルペンdeoxyphomenoneの機能

    令和2年度日本植物病理学会関西部会  2020年11月

研究シーズ 【 表示 / 非表示

  • 微生物による植物病害の防除作用と 病原菌の感染制御メカニズムに関する研究